没有之后在功能基冈缀时代，不同技术间的渗透结台对生物基因组中各基冈的时空表达调控研究是必不可少的。对基冈功能的研究，可以了解基冈所形成的代谢网络，如何在不同冉ｑ环境条件卜影响个体发育过程，并最终解释复杂的生命过程。
１．３比较图谱与比较基因组学
比较基冈统学是基因组学的重要分支。它是随人类基因组计划，特别是随人类与其它生物基冈组的火规模序列分析而发展起来的新学科，现已成研究生物基因组的最重要的策略与手段。利＿ｌ｝ｊ不同物种基闭组之间编码序列和组织结构上的同源性．克隆控锏性状的基冈，揭示基因的功能和性状发生的分子机制，阐明物种进化的关系及基因组的内在结构．这就是比较基因组学。
在整个生物圈中，所有物种的基因都是由一个或一组始祖基团通过加倍（ｄｕｐｉｉｃａｔｉｏｎ）与丈规模的遗传扩展（ｅｎｏｒｍｏｕｓｇｅｎｅｔｉｃｅｘｐａｎｓｉｏｎ）演变而来。这一演变的规模与层次可以是一段不
艮的核酸分子，也可能是能对选择压力进行反应的较为独立的结构与功能单位，也可能包括许多这样的单位、彼此有一定联系的染色体片段，也可能是一个较为完整的染色体，还可能是整
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土量垒兰叁兰生：：兰竺鎏耋。，，。。，，。。。。。。。。。。，，。。。。，，，，。。，，，耋三：耋ｉ：坠耋耋个基冈组的加倍及多倍体化（ｐｏｌｙｐｌｏｉｄｉｚａｔｉｏｎ），这些进化代表了一个物种所有遗传信息的基因
组进化，而不是个别基因、片段进化事件的简单累加与修饰。可以这样假设，人类与其他哺乳动物有一个麸同的祖先，在漫长的进化中，染色体发生断裂、重排，ａｎ上基因内部的不断变异，
成为各种不同的物种。但是未发生断裂重排的完整片段内部的基嗣的组织和连锁顺序在不同的
物种中保持不变，从而在相当程度上保留了基冈的整体性与连续性．即不同物种基因连锁的同
线性关系（ｓｙｎｔｅｎｙ）。这也是比较基因组学研究和基闻组比较作图的基础所在。
比较遗传定位使检测亲缘关系较远的动物间的同源染色体片段成为可能。对鸡的基因组研
究结果表明，鸡的基冈组与人的基因组有很好的同线性关系。因此与其他模式生物相比较，鸡
可能是一种研究人类基因组的更好的模式生物。鸡的一个染色体组有３９条染色体，但由于其中
的３０条为微小染色体，所以研究起来较为困难。然而对ＣｐＧ岛和ＧＣ含量的研究结果表明，
仅占基因组ＤＮＡｌｌ４人小的这些小染色体很可能含有鸡的多数基因（Ｓｍｉｔｈｊ等，２０００ｂ），从而使
基冈的平均密度可能达到１０ｋｂ一个基因。而且鸡的基因内含子比人类同源基因的内含子要小。
由丁』鸡的基因组的特性，有关鸡的基因组的比较研究已经引起了更多的兴趣。
１．４鸡的ｚ染色体研究
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图ｌ２鸡ｚ染色体细胞遗传图谱。
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目前定位在Ｚ染色体上的ＱＴＬ包括产蛋数量，产蛋质量，初产蛋时问，蛋壳强度，疾病垫譬等性状（ＰａｕｌＭ－Ｈｏｃｋｉｎｇ等，２００３）。此外ＩＤ基因也通过经典遗传学的方法定位在ｚ染色体
末端。但是鸡ｚ染色体的基因组学研究却很缺乏。
目前定能在ｚ染色体上的分子标记仅为８１个（见表１．１），覆盖２０１ｃＭ。其中包括１７个
基因或ＥＳＴ标记，２１个微卫星标记或小卫星标记，４１个ＡＦＬＰ，ＲＡＰＤ，ＲＦＬＰ，ＣＲｌ标记，
中国农业大学博士学位论文第一章文献综述其连锁关系如图１．２和图１．３（ｈｔｔｐ：／／ｐｏｕｌｔｒｖ．ｍｐｈ．ｍｓｕ．ｅｄｕ／ｒｅｓｏｕｒｃｅｓ／Ｃｏｎｍａｐ／ｃｏｎｍａｐ．ｈｔｍ）。基因组草图公布后，ｚ染色体上的信息有所增加。目前可以使用的基闲组序列中共包括３０８３２４９２ｂｐ己排列好的连续序列，跨越了染色体３３６５１１６９ｂｐ染色体区段。同时还包括１４３４８６１５ｂｐ的随机序列，跨越了１４９９４５７０ｂｐ的染色体区段。但是这个草图距离全面地完成基因组序列图谱还有很大的距离（一ｈｔｔｐ：ｌ／ｗｗｗ．ｇｅｎｏｍｅ，ｗｕｓｔｌ．ｅｄｕ／ｐｒｏｊｅｃｔｓ／ｃｈｉｃｋｅｎｌｉｎｄｅｘ．ｐｈｐ）。目前在ｚ染色体上还有许多缺口需要填补，而且未定位的序列占到整个区域的ｌ，３左右，冈此还需要迸一步完善。
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图１．３鸡ｚ染色体的一致图谱。
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