最终版PCR SOP体系文件

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8 结果判断:

8.1 阴性结果判定:如果增长曲线不呈S型或Ct值=30,则实验结果判为样品的UU DNA总含量小于检测极限。

8.2 阳性结果判定:如果增长曲线呈S型曲线且Ct值<30,则: a ) 若样品的Qty≤1×108,则痰液标本的MP DNA含量=Qty/4基因拷贝/ml,咽拭子标本的MP

DNA含量=Qty/20基因拷贝/ml; b ) 若实验结果,样品的Qty>1×108,则痰液标本的MP DNA含量为>2.5×107基因拷贝/ml,

咽拭子标本的MP DNA含量>5×106基因拷贝/ml。如果需要精确定量结果,可将提取后的样品稀释100倍再检测。 c ) 若样品的Qty<1×104,则痰液标本的MP DNA含量<2.5×103基因拷贝/ml,咽拭子标本的

MP DNA含量<500基因拷贝/ml;

9 质控

a ) 阴性质控品:全部阴性; b ) 阳性质控品:全部阳性,且强阳性质控品检测值允许范围在2.5×106基因拷贝/ml~4.0×107

基因拷贝/ml范围,弱阳性质控品定量参考值在2.5×104基因拷贝/ml~4.0×105基因拷贝/ml范围;(参考值为仪器自动分析计算出的数值); c ) 阳性定量参考品:均为阳性,且线性相关系数0.97≤|r|≤1; d ) 以上要求需在同一次实验中同时满足,否则,本次实验无效,需重新进行。

10 参考范围

低于检测下限

11 性能指标

灵敏度:1.0×104基因拷贝/ml

线性范围:1.0×104基因拷贝/ml~1.0×108基因拷贝/ml

12 临床意义

肺炎支原体是呼吸道感染较常见的致病菌,近几年有增加趋势,感染后除引起以往认为的非典型肺炎外,还可引起肺外各系统改变,且有死亡病例报道。采用PCR方法检测肺炎支原体DNA,可早期、快速、准确、敏感地诊断肺炎支原体感染。

13 注意事项

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13.1 实验室管理应严格按照PCR基因扩增实验室的管理规范,实验人员必须进行专业培训,实验过程严格分区进行(试剂准备区、标本制备区、扩增和产物分析区),所用消耗品应灭菌后一次性使用,实验操作的每个阶段使用专用的仪器和设备,各区各阶段用品不能交叉使用;

13.2 为试剂和标本制备阶段提供生物安全柜,实验过程中穿工作服,带一次性手套,使用自卸管移液器;

13.3 对每次实验进行质量控制;

13.4 试剂使用前要完全解冻,但应避免反复冻融; 13.5 自备灭菌生理盐水;

13.6 标本处理时“去上清”步骤,注意吸头不要碰触沉淀;

13.7 试剂盒DNA提取液内含不溶于水的物质,取样时需用加样器充分混匀后吸取。如出现因吸头嘴部太细不能吸取或取样后堵塞吸头现象,可先用洁净无污染的剪刀将吸头嘴部剪去一截;

13.8 标本制备区所用过的吸头请打入盛有消毒剂的容器,并与废弃物一起灭菌后方可丢弃; 13.9 实验完毕用10%次氯酸或75%酒精或紫外灯处理工作台和移液器;

13.10 所有检测样品应视为具有传染性物质,操作和处理均需符合相关法规要求:卫生部《微生物生物医学实验室生物安全通用准则》和《医疗废物管理条例》。

14 参考文献

中华人民共和国卫生部医政司编.全国临床检验操作规程(第三版) .南京:东南大学出版社,2006

中山大学达安基因股份有限公司. 肺炎支原体核酸定量检测试剂盒(PCR—荧光探针法)说明书.2007年12月,第一版/0 批准记录 批准人

批准时间 有效期 □1年;□其他: □1年;□其他: □1年;□其他: □1年;□其他: □1年;□其他: 第 39 页/共 93 页

淋球菌核酸定量检测标准操作程序 发布部门:XXXXXX医院检验科 分发范围: 检验科PCR室 编写者: XXX 审核者:XXX 批准者:XXX 文件编号:PCR(N)-SOP-108 版本/修订号: A/0 实施日期: 2012年5月1日 1 项目名称

淋球菌核酸定量检测

2 检验方法名称

TaqMan荧光定量检测

3 方法学原理

用一对淋球菌特异性引物和一条淋球菌特异性荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个荧光报告基团(R)和一个荧光淬灭基团(Q)。探针完整时,R基团发射的荧光信号被Q基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5’-3’外切酶活性将探针酶切降解,使R荧光基团和Q荧光基团分离,Q基团对R基团的抑制吸收作用消失,荧光监测系统就可接收到R基团的荧光信号。每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成。被切割产生的荧光分子数与PCR产物的数量成比例,这样就实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。因此根据PCR反应液的荧光强度即可计算出初始模板的数量。

4 标本要求

4.1 适用标本类型:生殖泌尿道分泌物棉拭子。 4.2 标本采集(生殖泌尿道分泌物棉拭子) a ) 男性—用细小棉拭子伸入尿道约2~4厘米,捻动拭子采集分泌物,将棉拭子置入无菌玻璃

管,密闭送检(采集分泌物前2小时禁小便)。 b ) 女性生殖道—用无菌生理盐水棉球洗去宫颈外分泌物,再用无菌棉拭子插入宫颈内,停5

秒钟后旋动棉拭子采集宫颈分泌物,将棉拭子置入无菌玻璃管,密闭送检。 c ) 女性尿道—用无菌生理盐水棉球洗净尿道口,再用无菌棉拭子插入尿道约2厘米,捻动拭子

采集分泌物,将棉拭子置入无菌玻璃管,密闭送检。

4.3 标本保存:标本可立即用于测试,也可以保存于-20℃待测,保存期为6个月。

5 试剂

5.1 试剂名称:淋球菌核酸定量检测试剂盒(PCR-荧光探针法) 5.2 生产厂家:XXXXXXXX; 5.3 试剂货号:#DA-B053; 5.4 包装规格:20人份/盒; 5.5 试剂成份: 组成部分 DNA提取液(500μl/管) NGH PCR反应液(400μl/管) Taq酶(60μl/管) 第 40 页/共 93 页

数量 2管 2管 1管

组成部分 NGH阴性质控品(150μl/管) NGH强阳性质控品(200μl/管) NGH临界阳性质控品(200μl/管) NGH阳性定量参考品(1.0×104基因拷贝/ml)10μl/管 NGH阳性定量参考品(1.0×105基因拷贝/ml)10μl/管 NGH阳性定量参考品(1.0×106基因拷贝/ml)10μl/管 NGH阳性定量参考品(1.0×107基因拷贝/ml)10μl/管 5.6 试剂储存条件:保存于—20℃,有效期6个月。 数量 1管 1管 1管 1管 1管 1管 1管 6 仪器

ABI 7500全自动基因扩增检测仪

7 操作步骤

7.1 DNA提取

7.1.1 阴性质控品处理 a ) 取出阴性质控品,8,000rpm离心数秒,吸50μl至0.5ml灭菌离心管中,加入50μl DNA

提取液充分混匀,100℃恒温处理10±1分钟; b ) 12000r/min离心5min,备用。 7.1.2 标本处理

7.1.2.1 生殖泌尿道分泌物棉拭子 a ) 向玻璃管中加入1 ml灭菌生理盐水,充分震荡摇匀,挤干棉拭子; b ) 吸取全部液体转至1.5ml离心管中,12,000rpm离心5分钟; c ) 去上清,沉淀加灭菌生理盐水1ml混匀,12,000rpm离心5分钟 d ) 去上清,沉淀中加入50μl DNA提取液充分混匀,100℃恒温处理10±1分钟; e ) 12,000 rpm离心5分钟,备用。

7.1.3 NGH临界阳性质控品处理(同阴性质控品); 7.1.4 NGH强阳性质控品处理(同阴性质控品);

7.1.5 NGH阳性定量参考品处理:8000rpm离心数秒,备用; 7.2 PCR扩增

7.2.1 试剂准备(在试剂准备区操作):按比例(NGH PCR反应液40μl/人份+ Taq酶3μl/人份)取相应量的PCR反应液及Taq酶,充分混匀后按43μl/管分装至0.2ml离心管中备用。

7.2.2 加样:向准备好试剂的0.2ml离心管中,分别加入处理后的样品(包括样本、阴性质控品、临界阳性质控品和强阳性质控品)上清液2μl,或直接加入阳性定量参考品2μl,8000rpm离心数秒,放入仪器样品槽。

7.2.3 设置PCR循环扩增程序如下

93℃ 2分钟 预变性;

93℃ 45秒 → 55℃ 60秒 10个循环 93℃ 30秒 → 55℃ 45秒 30个循环

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