1.非编码RNA的分类及概念 1.1分类
非编码RNA(non-coding RNA)是指转录组中不翻译为蛋白质的
RNA分子。
广包括相对分子量较小的 (核内小分子 RNA(small nuclear RNA ,snRNA)、 核仁小分子 RNA(small nucleolar RNAs , snoRNA)、 微 RNA(microRNA ,miRNA)、
'piwi-i nteracti ng RNA(piRNA)
k
干扰小 RNA ( Small interfering RNA ,siRNA)
以及相对分子量较大的 长非编码 RNA(long non-coding RNA , IncRNA)等。
1.2概念:
snRNA :核内小分子 RNA(small nuclear RNA),它是真核生物转录后加工过程中
体(spliceosome)的主要成分,参与 mRNA前体的加工过程。
RNA剪接
snoRNA :核仁小分子 RNA (small nucleolar RNAs ),它在核糖体 RNA 的生物合成中发挥
作用,另外还能够指导 snRNA、tRNA和mRNA的转录后修饰。
miRNAs :微小RNA( microRNAs),是一类由内源基因编码的长度约为
码单链 RNA 分子,通过与靶标 3'-UTR)特异性结合,从而引起靶标 与转录后基因表达调控。
22个核苷酸的非编
mRNA 的3'端非翻译区(3'-untranslated region, mRNA分子的降解或翻译抑制,在动植物中参
piRNAs ( Piwi-interactingRNA): piRNA 基因是一类长度为 24? 32 nt 的的单链小 RNA,有
很强的正义链和反义链专一性, 其5'端第一个核苷酸有尿嘧啶倾向性, 3'端被2'-O- 甲基化修饰,这类末端修饰可防止成熟体 piRNA基因降解.piRNA主要与PIWI亚家 族成员Piwi蛋白或AGO3蛋白质结合而发挥作用。
siRNA :干扰小 RNA( Small interfering RNA),是一种小 RNA分子,由Dicer酶加工而成。
双链RNA经酶切后会形成很多小片段, 补的目标mRNA的沉默。
siRNA是siRISC的主要成员,激发与之互
IncRNA :长链非编码 RNA ( Long non-coding RNA ), IncRNA 是长度大于 200个核苷酸的 非编码RNA。
研究表明,IncRNA在剂量补偿效应、表观遗传调控、细胞周期调控 和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用,成为遗传学研究热点。
miRNA和siRNA的区别主要有两点:(1)miRNA是内源性的,是生物体基因的表达 产物;siRNA是外源性的,来源于病毒感染、转座子或转基因靶点。
(2)miRNA是由不完
整的发卡状双链 RNA,经Drosha和Dicer酶加工而成;siRNA是由完全互补的长双链 RNA, 经Dicer酶剪切而成。
lable I. ( lassifitdilioii imHi-ceding RNAs based on tlwir iunclioiis
Ca护即ry Membem
Housekeeping ncRNA
rltNA iKNA
siiaoRNA
HIIRNA
Milin 恤叮厲応阳
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1 加ni旷i]詁itR in H N A editing Slab 1^ chmnin^nni^ strurturFi
Negirtive ve^uliite ml?NA ond rrther mJeculea
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siiRNA Inf RNA
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and DNA methylalijon
Silerricr ram卩Irnnrnlarv taq;K mUN A
|{rgijlal:£ cxprfssicsn in rpi羽rrirtir:^ Itmnscnj^ticmal jjnd Hrarisfriptitrmail IfYclh
rHNAf RNA ; tHNAf trarisfrr RNA r snoRNAa snidI nurlrcjliir KNJ 悴HUKLIJ nurlrar UNA: tmHNAj transfrr^
mrsMTiprT HNA: gpMA, piid(? RNAr npRNA’ iwn-rodin^ RNA; miRNA, micnoRNAt piRN.'V, Plft 1 ijitrrartinp RNA; RIRNA., wmall intrifeTinf HNA; JnfRNAR Inn^ nnn-rodinp RNA
图:莫小燕等,非编码 RNA在肿瘤细胞糖代谢中的调控作用
[3]
1.3 siRNA、miRNA 及 piRNA 的生物合成
a:(人类)siRNA来源于长的双链 RNA分子,经Dicer酶剪切为21-25nt的双链RNA片段, Dicer酶和dsRNA结合蛋白将siRNA二聚体装载至 Argonaute蛋白(AGO2 )而发挥作用; b:(人类)miRNA由内源性的生物体基因产生含有发卡结构的 发卡结构在细胞核内经
Drosha-DGCR8复合物加工产生
65-7Ont长的pri-miRNA,该 pre-miRNA。在细胞浆内,
pre-miRNA 进一步经 Dicer酶剪切为 miRNA-miRNA* 二聚体(其中 miRNA 为引导链, miRNA*为信息链),装载至Argonaute蛋白1(AGO1)而发挥作用。c:(鼠类)piRNA的生 物合成尚不清楚。piRNA来源于单链RNA前体,而且不依赖于 Dicer酶。产生的初级正义
反义 piRNA 中 MIWI2 比 MILI
更为丰富,次级反义 piRNA可能直接裂解转座子 mRNA。
AAAAA
siRNA duplex
RISC complex
AG02 RISC
piRNA倾向于与 MILI结合,在出生前的睾丸、
MILI和MIWI2均参与复制周期,在次级
图:于红,表观遗传学:生物细胞非编码 RNA调控的研究进展
Transposon transcripts
2、MicroRNA 的功能
Drosha
2.1 miRNA 参与细胞自噬调控 ⑴。
AAAJsA
在自噬的启动(induction)、囊泡成核(vesicle nueleation)、囊泡延伸(vesicle elongation)、 自
MIWI2J 噬回收(Retrieval)与囊泡融合(fusion)等几个阶段中均参与调控。 此外,miRNA也可通过其 MILI他方式
AG02
RISC 调节细胞自噬。直接调控,直接作用的位点目前发现有leading
miRNA-rniRNA\
TRBP
Pre-mlRNA
Antisense secondary
:对STMN1基因(该基因编
duplex
码的Stathmin蛋白被发现参与自噬调控),DRAM2 ,IRGM,线粒体自噬受体 FUNDC1 和NIX等。间接
Transposon AGD2
调控,即通过对细胞分子通路中重要的调控性蛋白进行调控,从而间接地 mRNA pre-lRISC
调控自噬的过程。调控靶点有: SMAD4,FOXO3,ATM,RUNX3,p53; EZH2,PI3K/AKT 通路,hnRNP A1,EGFR 等。
AG01
pn-RISC
sense primary
TGS
AG01 RISC
TGS