5 10×电极缓冲液,pH8.3(pH8.3-甘氨酸缓冲液) Tris 30克,甘氨酸144克,SDS 10g,溶于无离子水后定容至1000 ml,用时稀释10倍。 考马斯亮蓝R-250 0.125g、50%甲醇227 ml(即甲醇113.5加水113.5毫升),冰乙酸23毫升。总体积250毫升 冰乙酸75毫升,甲醇50毫升,加水至1000毫升 6 染色液 7 脱色液 五、实验步骤 1、凝胶的制备
(1)将贮液由冰箱取出,待于室温平衡后再配制工作液。
(2)用橡皮圈把凝胶管扎起,垂直放在小培养皿中,倒入2%琼脂糖溶液,令其自然凝固。 (3)按下表比例配制分离胶:
表1配制分离胶比例
名称 分离胶缓冲液 Acr-Bis贮液 1.3 ml 2 ml 过硫酸铵 150 μl TEMED 10 μl 重蒸水 1.6 ml 取用量(5ml) (4)灌分离胶:分离胶缓冲液和Acr-Bis贮液和重蒸水放一烧杯,加入过硫酸铵和TEMED然后小心混合溶液,用长滴管取混合的溶液。沿管壁加入胶液,当加到玻璃管高度2/3时,在表面覆盖一层水,刚加过水可看出界面,后逐渐消失,等在看出界面时,表明分离胶已聚合。再静置20-30分钟,吸取表面水分,(正常情况10 min开始聚合,应控制在30min~1h内聚合完成)。
(5)浓缩胶的制备:按下表比例配制浓缩胶。
表2配制浓缩胶比例
名称 浓缩胶缓冲液 Acr-Bis贮液 0.25 ml 0.33 ml 过硫酸铵 450 μl TEMED 5 μl 重蒸水 1.4 ml 取用量(2ml) (6)灌浓缩胶:浓缩胶缓冲液和Acr-Bis贮液和重蒸水放一烧杯,加入过硫酸铵和TEMED然后小心混合溶液,用长滴管取混合的溶液。沿管壁加入胶液,当加到分离胶上面约1cm高度,表面覆盖一层水,聚合20-30分钟,除去表面水分。 2、样品的制备
蛋白质样品200微升,上样缓冲液25微升混合,留作点样用。 3、装槽、点样
13
(1)装槽:装下槽电极缓冲液,将稀释10倍的电极缓冲液约100 ml放入下槽,安好装有凝胶管的上槽;
装上槽电极缓冲液,在上槽内加一滴溴酚蓝指示剂,将稀释10倍的电极缓冲液放入上槽,淹没凝胶管上端1-2 cm。
(2)点样:用微量注射器在浓缩凝胶顶部加样,加样时,微量注射器的针头伸入凝胶孔的内部,但针头不要碰到胶面,缓缓加入,因样品比重较大,因此样品液自动沉降在胶面上平铺成一层。 4、电泳
按正负极接通电源,打开电泳仪(仔细观察正负极的变化)。电流控制在1mA/管,待溴酚蓝至分离胶时,加大电流升到2mA/管,太高的电流强度会造成产热量大,使分离失效。如果高温对样品不利,可降低电流,延长时间,或进行有效的冷却。待指示染料迁移至下沿约0.5 cm处停止电泳,需2---3 h。
5、剥胶:电泳结束,取下凝胶管,用注射器沿玻璃管壁慢慢注入蒸馏水转动360度,小心地将凝胶压出(用洗耳球)。
6、固定,染色及脱色::将取下的胶条放入染色液中染色8~15 h,这期间用保鲜膜将染色盘封好,置于水平摇床上,最好避光染色。注意:染色液一般为凝胶体积的5~10倍。脱色后显现出清晰的蛋白点。 六、注意事项
1、配好的贮液用棕色瓶盛装冰箱内保存,可放1~2个月。(使用前真空泵抽气10 min ) 2、过硫酸铵应当天配制。 3、如有不溶物要过滤。 4、显色液用前再混合。 5、电极缓冲液用时稀释10倍。
七、思考题
每组同学的样品,经过电泳分离之后,蛋白质的条带会有什么差异吗?说明原因。
14
第四部分 鱼类种群生物指标的测定
实验八 鱼类种群形态学性状的测定
一、实验目的
通过对鱼类可量和可数性状的大量测定和统计分析,要求确立种群的概念,掌握传统的依据形态学特征鉴别种群的原理和方法。 二、基础理论
种群在生态学上可以理解为种内个体栖息在同一生态环境(或同一水体)里所形成的组合群。由于多数物种在自然界的分布呈镶嵌型,即以不规则的组合群或间隙的格局存在。如果间隙宽到一定的程度,就可以把所调查区域内所有同种个体作为一个种群、或群体来研究。因此,一个种群与同种的另一种群常有某种程度的地理或生态隔离(间隙),从而在遗传上造成离散性,导致相互间在形态、生态、生理以及数量变动上的差异。这些差异就成为鱼类种群鉴别的基础。
形态学性状测定是鉴别种群最常用的方法之一。主要是通过对鱼类个体的可数性状和
可量性状的大量测定,然后用生物统计法进行归纳、分析和判别。通常,对比单项特征的差异,常用均数差异显著性检验(Mdiff)公式;若需要综合检验多项特征之间的差异,可用判别函数分析法。可数性状主要包括鳍条、侧线鳞、鳃耙、脊椎骨和幽门盲襄等。可量性状长期来主要以体长、体高、头长、眼径和吻长等为测定指标,称传统测定法。但近十年来,国外一些学者认为:传统测定法研究的形态度量特征,集中于从头部到尾部的长轴上,不足以包含整个体形,因而提出了一种把鱼体分成若干网格(图E-1),测量各联结点距离的方法,称为框架形态测定分析法。不同体型的鱼种可有不同的框架。李思发等(1991)
15
采用传统、框架以及传统+框架三种方法,研究分析团头鲂种群的形态差异,证实框架测定法能显著提高对种群的判别。 三、材料和器材
随机任选一批鲫的标本;如有两批采自不同地区的同一种标本,予以比较则更为理想。标本数根据学生人数确定。所需器材为量鱼板、两脚规、镊子、天平、放大镜、解剖盘和烧锅等,以及根据所要求观测项目所设计的生物学资料登记表。 四、步骤和方法
每两人一组,测定10尾标本。
1、编码:用小纸片给标本编好号码,贴在鳃盖上。第一组为1—10,第二组为11—20,依次类推。在登记表上填写鱼名、编号、标本采集日期,渔具、地点,测定人和测定日期等。
2、传统测定项目:在量鱼板上测量全长、体长;用两脚规测体高、体宽、头长、吻长、眼径等。若干测量项目标准如下。
全长——从鱼体最前端至尾鳍末端的水平长度。
体长——从鱼体最前端至尾鳍基最后一个鳞片的水平长度。 体高——鱼体背缘至腹缘间的最大垂直距离。 体宽——鱼体两侧最宽处的距离。
头长——从鱼头部最前端至鳃盖骨后缘的水平长度。 吻长——从吻端至眼眶前缘间的水平长度。 眼径——与鱼体纵轴平行的眼眶内径水平长度。 尾柄长——从臀鳍基部末端至尾鳍基的水平长度。 尾柄高——尾柄部最低高度。
3、 框架测定项目,按团头鲂的体型(图E—1),可供潮钠框周项有:2—4,4一书,6—8,8—10,1—3,3—5,,5—7,7—9,2—1,4—3,6—5,8—7,10一9;框内项有:1--4,2—3,4—5,3—6,6—7,5—8,8—9,7一10,共21项。
(4)计数项目。鳍式——记载背鳍(D)、臀鳍(A)的鳍式。真棘数用大写罗马字,假棘,又称刺,用小写罗马字;鳍条用阿拉伯数字表示;棘和鳍条之间可用圆点。例如,鲫的背鳍鳍式:Diii·15~19。 侧线鳞式——侧线鳞
侧线上鳞例如,鲫的侧线鳞式:
侧线下鳞至腹鳍(v)或臀鳍(A)16